L’elecció del règim inicial ha de ser realitzada d’acord amb els resultats del test de resistència, les toxicitats, les comorbiditats, les interaccions medicamentoses, la posologia i la quantitat de pastilles; sobre aquest tema, en general es prefereixen les formulacions amb dosi fixa i la presa una vegada al dia.
El tractament inclou tres fàrmacs actius, preferentment dos ITIAN i, com a tercera opció, un ITINN, una IP potenciada o un inhibidor de la integrasa. La interrupció programada del tractament no es recomana, atés que s’ha observat major risc de malalties oportunistes i mort en aquests pacients, a més d’una menor recuperació de limfòcits CD4, en comparar-los amb pacients en tractament continu.
La monoteràpia tant amb ITIAN com amb IP/r no està recomanada com a teràpia d’inici. De la mateixa manera, els règims duals amb ITIAN i els que inclouen tres ITIAN no han de ser utilitzats, ja que no han demostrat posseir una activitat antiviral potent i sostinguda.